Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSOP43234 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSOP43234 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSOP43234 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSOP43234 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSOP43234 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSOP43234 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSOP43234 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSOP43234 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSOP43234 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSOP43234 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms