Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGER3P43115 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER3P43115 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms