Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTGFRP43088 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGFRP43088 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms