Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA2P42262 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms