Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC1P41238 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms