Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPARGP37231 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPARGP37231 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPARGP37231 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPARGP37231 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGP37231 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGP37231 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGP37231 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGP37231 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGP37231 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms