Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2IP36954 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms