Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGFBR1P36897 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms