Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL4P36578 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL4P36578 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL4P36578 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL4P36578 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL4P36578 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL4P36578 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL4P36578 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL4P36578 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL4P36578 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL4P36578 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL4P36578 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL4P36578 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms