Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT4P35916 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT4P35916 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLT4P35916 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLT4P35916 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLT4P35916 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FLT4P35916 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FLT4P35916 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
FLT4P35916 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
FLT4P35916 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
FLT4P35916 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
FLT4P35916 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLT4P35916 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT4P35916 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT4P35916 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT4P35916 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT4P35916 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT4P35916 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT4P35916 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLT4P35916 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLT4P35916 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FLT4P35916 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLT4P35916 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLT4P35916 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLT4P35916 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLT4P35916 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLT4P35916 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms