Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT2P35908 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT2P35908 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT2P35908 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT2P35908 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT2P35908 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT2P35908 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT2P35908 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT2P35908 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT2P35908 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT2P35908 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT2P35908 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT2P35908 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms