Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFTPDP35247 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms