Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC1P35052 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC1P35052 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC1P35052 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC1P35052 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC1P35052 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC1P35052 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC1P35052 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC1P35052 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC1P35052 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC1P35052 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC1P35052 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPC1P35052 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPC1P35052 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms