Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSF2RBP32927 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2RBP32927 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms