Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA4P25789 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA4P25789 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA4P25789 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA4P25789 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA4P25789 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMA4P25789 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms