Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TACR1P25103 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TACR1P25103 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TACR1P25103 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TACR1P25103 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TACR1P25103 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TACR1P25103 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TACR1P25103 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TACR1P25103 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TACR1P25103 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TACR1P25103 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TACR1P25103 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TACR1P25103 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TACR1P25103 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TACR1P25103 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TACR1P25103 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms