Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR2AP24928 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR2AP24928 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms