Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF4P23510 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF4P23510 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms