Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCP20941 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCP20941 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCP20941 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCP20941 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCP20941 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCP20941 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCP20941 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCP20941 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCP20941 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCP20941 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCP20941 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCP20941 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCP20941 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCP20941 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCP20941 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCP20941 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCP20941 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCP20941 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCP20941 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCP20941 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCP20941 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCP20941 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCP20941 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCP20941 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCP20941 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCP20941 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCP20941 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCP20941 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCP20941 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCP20941 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCP20941 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCP20941 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCP20941 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCP20941 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCP20941 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCP20941 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCP20941 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCP20941 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms