Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB1P20618 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB1P20618 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB1P20618 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms