Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRB1P17538 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRB1P17538 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms