Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6AP16499 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms