Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA1P15976 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA1P15976 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA1P15976 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA1P15976 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA1P15976 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GATA1P15976 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GATA1P15976 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATA1P15976 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATA1P15976 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATA1P15976 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATA1P15976 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GATA1P15976 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms