Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF3P15923 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF3P15923 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF3P15923 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF3P15923 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF3P15923 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF3P15923 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF3P15923 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF3P15923 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF3P15923 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF3P15923 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF3P15923 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF3P15923 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF3P15923 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF3P15923 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF3P15923 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms