Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT10P13645 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT10P13645 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT10P13645 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT10P13645 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT10P13645 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT10P13645 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT10P13645 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT10P13645 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT10P13645 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT10P13645 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT10P13645 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT10P13645 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT10P13645 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT10P13645 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT10P13645 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT10P13645 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT10P13645 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT10P13645 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT10P13645 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT10P13645 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT10P13645 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT10P13645 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms