Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFHP12036 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEFHP12036 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEFHP12036 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEFHP12036 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEFHP12036 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEFHP12036 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEFHP12036 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEFHP12036 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms