Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESRRAP11474 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ESRRAP11474 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESRRAP11474 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms