Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR2F1P10589 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NR2F1P10589 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR2F1P10589 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms