Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GLI3P10071 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GLI3P10071 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GLI3P10071 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GLI3P10071 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GLI3P10071 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GLI3P10071 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GLI3P10071 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GLI3P10071 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GLI3P10071 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI3P10071 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI3P10071 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI3P10071 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI3P10071 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI3P10071 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI3P10071 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GLI3P10071 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GLI3P10071 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI3P10071 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI3P10071 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI3P10071 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI3P10071 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GLI3P10071 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI3P10071 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI3P10071 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI3P10071 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GLI3P10071 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GLI3P10071 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GLI3P10071 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GLI3P10071 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GLI3P10071 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GLI3P10071 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GLI3P10071 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI3P10071 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI3P10071 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI3P10071 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI3P10071 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI3P10071 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GLI3P10071 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GLI3P10071 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GLI3P10071 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GLI3P10071 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GLI3P10071 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GLI3P10071 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GLI3P10071 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GLI3P10071 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GLI3P10071 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GLI3P10071 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms