Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMIM13P0DJ93 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms