Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP9P0CG40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP9P0CG40 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms