Protein–RNA interactions for Protein: P08559

PDHA1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDHA1P08559 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDHA1P08559 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms