Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGF1P05230 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGF1P05230 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGF1P05230 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGF1P05230 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGF1P05230 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGF1P05230 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGF1P05230 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGF1P05230 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGF1P05230 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGF1P05230 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGF1P05230 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGF1P05230 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGF1P05230 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGF1P05230 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGF1P05230 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGF1P05230 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGF1P05230 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGF1P05230 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms