Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCGP05129 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms