Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBC1P01850 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC1P01850 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBC1P01850 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms