Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBED1O96006 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
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