Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM13AO94988 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms