Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3JO75822 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF3JO75822 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3JO75822 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3JO75822 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3JO75822 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF3JO75822 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms