Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEDO75530 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEDO75530 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEDO75530 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEDO75530 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEDO75530 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEDO75530 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEDO75530 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEDO75530 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EEDO75530 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEDO75530 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEDO75530 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEDO75530 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEDO75530 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEDO75530 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EEDO75530 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEDO75530 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEDO75530 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEDO75530 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EEDO75530 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EEDO75530 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms