Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms