Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP12O75317 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP12O75317 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP12O75317 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP12O75317 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP12O75317 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP12O75317 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP12O75317 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP12O75317 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP12O75317 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP12O75317 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms