Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC25A20O43772 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC25A20O43772 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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