Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGTAO43765 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGTAO43765 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGTAO43765 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGTAO43765 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGTAO43765 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGTAO43765 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGTAO43765 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGTAO43765 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGTAO43765 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGTAO43765 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGTAO43765 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGTAO43765 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGTAO43765 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGTAO43765 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGTAO43765 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGTAO43765 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGTAO43765 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGTAO43765 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGTAO43765 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGTAO43765 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGTAO43765 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGTAO43765 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGTAO43765 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGTAO43765 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms