Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID2O43424 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRID2O43424 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID2O43424 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID2O43424 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRID2O43424 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID2O43424 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID2O43424 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID2O43424 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID2O43424 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRID2O43424 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRID2O43424 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRID2O43424 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID2O43424 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID2O43424 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID2O43424 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID2O43424 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID2O43424 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID2O43424 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRID2O43424 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID2O43424 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID2O43424 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms