Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN3O15551 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms