Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ARHGEF10O15013 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ARHGEF10O15013 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF10O15013 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms