Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ADAM15-221ENST00000485346 557 ntTSL 414.48□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 42.6
DDX3XO00571 WDR5-203ENST00000608937 705 ntTSL 219.74■□□□□ 0.756e-15■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 WDR5-202ENST00000608739 577 ntTSL 416.74■□□□□ 0.276e-15■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.096e-15■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 TSEN54-211ENST00000583818 765 ntTSL 517.42■□□□□ 0.385e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.178e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.998e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 221.11■□□□□ 0.978e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.978e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-210ENST00000519569 2355 ntTSL 221.05■□□□□ 0.968e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.798e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 219.09■□□□□ 0.658e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-215ENST00000520266 878 ntTSL 318.86■□□□□ 0.618e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.578e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 217.7■□□□□ 0.428e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.428e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.378e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.238e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 313.39□□□□□ -0.278e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-240ENST00000562292 735 ntTSL 510.39□□□□□ -0.758e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 39.85□□□□□ -0.838e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 38.47□□□□□ -1.058e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 57.67□□□□□ -1.188e-19■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RNF41-205ENST00000548225 1001 ntTSL 515.63■□□□□ 0.094e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RNF41-203ENST00000547967 2552 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RNF41-211ENST00000552656 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.764e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RNF41-201ENST00000345093 5596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RNF41-209ENST00000551711 582 ntTSL 57.56□□□□□ -1.24e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 P4HA2-211ENST00000428369 751 ntTSL 29.8□□□□□ -0.848e-13■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 CYP2U1-203ENST00000513302 1562 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.541e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.41e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 523.08■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-212ENST00000597467 821 ntTSL 323.08■■□□□ 1.296e-9■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 NUDT14-201ENST00000339418 570 ntTSL 221.44■■□□□ 1.021e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 521.07■□□□□ 0.964e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 NUDT14-206ENST00000551024 1042 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-218ENST00000599905 589 ntTSL 420.77■□□□□ 0.926e-9■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 NUDT14-203ENST00000546553 527 ntTSL 420.66■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.683e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 AC008763.2-202ENST00000599243 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 419.04■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 SDHB-203ENST00000466613 828 ntTSL 216.94■□□□□ 0.33e-28■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 516.31■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-28■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)15.72■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 315.31■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-206ENST00000567640 592 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 513.79□□□□□ -0.23e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 413.17□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 SDHB-207ENST00000485515 699 ntTSL 513.01□□□□□ -0.333e-28■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-202ENST00000391623 2853 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-11■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RBM8A-208ENST00000634130 565 ntTSL 211.3□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RBM8A-205ENST00000632040 495 ntTSL 210.54□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.781e-11■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 29.98□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 ARG2-203ENST00000557120 836 ntTSL 29.2□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 TRAF3-209ENST00000560463 701 ntTSL 39.19□□□□□ -0.949e-11■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 ST3GAL1-208ENST00000521627 454 ntTSL 38.93□□□□□ -0.983e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-209ENST00000570178 861 ntTSL 37.94□□□□□ -1.142e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-204ENST00000563479 590 ntTSL 37.94□□□□□ -1.142e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 RBM8A-207ENST00000633781 440 ntTSL 26.67□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 ARG2-202ENST00000556491 457 ntTSL 56.17□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-203ENST00000562398 575 ntTSL 45.03□□□□□ -1.62e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 HAUS2-205ENST00000564279 626 ntTSL 44.57□□□□□ -1.682e-16■■■■■ 42.5
DDX3XO00571 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 318.18■□□□□ 0.57e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-208ENST00000493177 813 ntTSL 314.15□□□□□ -0.147e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.187e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.217e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.257e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.367e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.637e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 MSH6-211ENST00000606499 833 ntTSL 38.12□□□□□ -1.117e-19■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 CTSB-207ENST00000524654 368 ntTSL 511.24□□□□□ -0.616e-34■■■■■ 42.4
DDX3XO00571 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-24■■■■■ 42.4
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