Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLRMTO00411 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms