Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DFFAO00273 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DFFAO00273 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFAO00273 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFAO00273 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFAO00273 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFAO00273 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFAO00273 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFAO00273 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFAO00273 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFAO00273 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFAO00273 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFAO00273 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFAO00273 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFAO00273 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFAO00273 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFAO00273 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DFFAO00273 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DFFAO00273 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DFFAO00273 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFAO00273 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFAO00273 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFAO00273 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFAO00273 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DFFAO00273 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms