Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF26H0Y7S4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF26H0Y7S4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms